Blast Search
Kör NCBI BLAST-sökningar för sekvenslikhet/homologi — kräver BLAST+ eller BioPython förinstallerat.
Tested · Didn't pass
Vad den gör
Kör lokala (blastn/blastp/blastx/tblastn) eller fjärranslutna NCBI BLAST+-sökningar för att hitta liknande DNA-, RNA- eller proteinsekvenser och identifiera gener genom homologi, presenterar träffar som en rankad tabell med identitet och E-värden. Utlöses vid förfrågningar om att BLAST:a en sekvens, hitta liknande sekvenser eller köra en homologisökning. Instruktionerna förutsätter en förkonfigurerad bioinformatik-container med BLAST+ och BioPython redan installerat, och ger ingen fallback när dessa binärer saknas.
Testrapport
Att följa SKILL.md bokstavligen stöter omedelbart på problem: blastn är inte installerat och det finns ingen fallback-vägledning, medan ett enkelt Python-skript på fem rader hittade samma 95% sekvensidentitet på under en sekund.
Testad: 2026-07-14 · Claude Code 2.x (agent harness)
Installation
git clone https://github.com/BioTender-max/awesome-bio-agent-skills cd awesome-bio-agent-skills mkdir -p ~/.claude/skills cp -r skills/bioclaw/blast-search ~/.claude/skills/blast-search
Kommandon och exempelprompter
/blast-searchKör NCBI BLAST-sökningar för sekvenslikhet/homologi — kräver BLAST+ eller BioPython förinstallerat.
Skills triggas av vanliga förfrågningar — inga kommandon att memorera. Efter installationen aktiverar prompter som dessa skillen (på engelska):
Can you BLAST this DNA sequence against the nt database for me?I need to find genes similar to this protein sequence via homology.Run a local blastp search comparing these two protein sequences.