MATLAB Fit SimBiology Model
Poprawne wzorce fitproblem/NLME/NCA do dopasowywania modeli PK w SimBiology; wyłapuje pułapki sbiofit.
Testowano · Działa
Co robi ten skill
Koduje poprawny przepływ pracy oparty na `fitproblem` do estymacji parametrów w SimBiology - opakowanie groupedData, składnię ResponseMap, ograniczenia, transformację logarytmiczną, modele błędów, wybór między NLME a sbiofit, wirtualnych pacjentów i NCA - tak by agent nie sięgał po podatne na błędy bezpośrednie wywołania pozycyjne sbiofit/sbiofitmixed, przed którymi jawnie ostrzega. Uruchamia się na słowach fit/estimate/calibrate/population/NCA/AUC; wyraźnie wyklucza budowę modelu i prośby o czystą analizę wrażliwości, które kieruje do sąsiednich skilli.
Raport z testu
Porównano kod dla jednokompartmentowego dopasowania PK doustnego: wersja bazowa bez skilla wywołuje sbiofit bezpośrednio na zwykłej tabeli bez ograniczeń (dokładnie ten podatny na błędy wzorzec, przed którym ostrzega dokumentacja skilla); wersja prowadzona przez skill opakowuje groupedData, ustawia ResponseMap='Drug = Drug', dodaje ograniczenia plus transformację logarytmiczną na ke/ka i zaczyna od scattersearch zgodnie z tabelą decyzyjną.
Testowano: 2026-07-13 · Claude Code 2.x (agent harness)
Instalacja
git clone https://github.com/matlab/matlab-agentic-toolkit cd matlab-agentic-toolkit mkdir -p ~/.claude/skills cp -r skills-catalog/computational-biology/matlab-fit-simbiology-model ~/.claude/skills/matlab-fit-simbiology-model
Komendy i przykładowe prompty
/matlab-fit-simbiology-modelPoprawne wzorce fitproblem/NLME/NCA do dopasowywania modeli PK w SimBiology; wyłapuje pułapki sbiofit.
Skille uruchamiają się na zwykłe polecenia — bez komend do zapamiętania. Po instalacji aktywują go prompty takie jak te (po angielsku):
Help me fit this PK model in SimBiology using fitproblem correctlyI need to calibrate population parameters with NLME instead of sbiofitSet up bounds and log-transform for this SimBiology parameter estimation