Blast Search
Uruchamia wyszukiwania NCBI BLAST pod kątem podobieństwa/homologii sekwencji — wymaga preinstalacji BLAST+ lub BioPython.
Tested · Didn't pass
Co robi ten skill
Uruchamia lokalne (blastn/blastp/blastx/tblastn) lub zdalne wyszukiwania NCBI BLAST+ w celu znalezienia podobnych sekwencji DNA, RNA lub białek i identyfikacji genów przez homologię, prezentując wyniki jako tabelę rankingową z tożsamością i wartościami E. Uruchamia się na żądania BLAST sekwencji, znalezienia podobnych sekwencji lub uruchomienia wyszukiwania homologii. Instrukcje zakładają wstępnie skonfigurowany kontener bioinformatyczny z zainstalowanymi BLAST+ i BioPython i nie przewidują rozwiązania awaryjnego, gdy te binaria są brakujące.
Raport z testu
Dosłowne przestrzeganie SKILL.md natychmiast napotyka problem: blastn nie jest zainstalowany i brak jest wskazówek awaryjnych, podczas gdy prosty pięcioliniowy skrypt Python znalazł tę samą 95% tożsamość sekwencji w mniej niż sekundę.
Testowano: 2026-07-14 · Claude Code 2.x (agent harness)
Instalacja
git clone https://github.com/BioTender-max/awesome-bio-agent-skills cd awesome-bio-agent-skills mkdir -p ~/.claude/skills cp -r skills/bioclaw/blast-search ~/.claude/skills/blast-search
Komendy i przykładowe prompty
/blast-searchUruchamia wyszukiwania NCBI BLAST pod kątem podobieństwa/homologii sekwencji — wymaga preinstalacji BLAST+ lub BioPython.
Skille uruchamiają się na zwykłe polecenia — bez komend do zapamiętania. Po instalacji aktywują go prompty takie jak te (po angielsku):
Can you BLAST this DNA sequence against the nt database for me?I need to find genes similar to this protein sequence via homology.Run a local blastp search comparing these two protein sequences.