MATLAB Fit SimBiology Model
Korrekte fitproblem-/NLME-/NCA-mønstre for SimBiology PK-tilpasning; fanger opp sbiofit-fallgruver.
Bestått
Hva den gjør
Koder inn den korrekte `fitproblem`-baserte arbeidsflyten for SimBiology-parameterestimering — groupedData-innpakking, ResponseMap-syntaks, grenser, log-transform, feilmodeller, valg mellom NLME og sbiofit, virtuelle pasienter og NCA — slik at en agent ikke griper til de feilutsatte direkte sbiofit/sbiofitmixed-posisjonskallene den eksplisitt advarer mot. Trigges av fit/estimate/calibrate/population/NCA/AUC-språk; ekskluderer eksplisitt modellkonstruksjon og rene sensitivitetsanalyse-forespørsler, som rutes til søsken-skills.
Testrapport
Sammenlignet kode for en enkeltkompartment oral PK-tilpasning: baseline uten skill kaller sbiofit direkte med en enkel tabell og ingen grenser (nøyaktig det feilutsatte mønsteret skillets egen dokumentasjon advarer mot); den skill-veiledede versjonen pakker inn groupedData, setter ResponseMap='Drug = Drug', legger til grenser pluss log-transform på ke/ka, og starter med scattersearch i tråd med beslutningstabellen.
Testet på: 2026-07-13 · Claude Code 2.x (agent harness)
Installer
git clone https://github.com/matlab/matlab-agentic-toolkit cd matlab-agentic-toolkit mkdir -p ~/.claude/skills cp -r skills-catalog/computational-biology/matlab-fit-simbiology-model ~/.claude/skills/matlab-fit-simbiology-model
Kommandoer og eksempelprompter
/matlab-fit-simbiology-modelKorrekte fitproblem-/NLME-/NCA-mønstre for SimBiology PK-tilpasning; fanger opp sbiofit-fallgruver.
Skills utløses av vanlige forespørsler — ingen kommandoer å huske. Etter installasjonen aktiverer prompter som disse skillen (på engelsk):
Help me fit this PK model in SimBiology using fitproblem correctlyI need to calibrate population parameters with NLME instead of sbiofitSet up bounds and log-transform for this SimBiology parameter estimation