SkillProof tested Claude skills

Blast Search

Kjører NCBI BLAST-søk etter sekvenslikhet/homologi — krever BLAST+ eller BioPython forhåndsinstallert.

av BioTender-max · BioTender-max/awesome-bio-agent-skills

Tested · Didn't pass

Blast Search — Kjører NCBI BLAST-søk etter sekvenslikhet/homologi — krever BLAST+ eller BioPython forhåndsinstallert.

Hva den gjør

Kjører lokale (blastn/blastp/blastx/tblastn) eller eksterne NCBI BLAST+-søk for å finne lignende DNA-, RNA- eller proteinsekvenser og identifisere gener ved homologi, og presenterer treff som en rangert tabell med identitet og E-verdier. Utløses ved forespørsler om å BLASTe en sekvens, finne lignende sekvenser, eller kjøre et homologisøk. Instruksjonene forutsetter en forhåndskonfigurert bioinformatikk-container med BLAST+ og BioPython allerede installert, og gir ingen reserveplan hvis disse binærfilene mangler.

Testrapport

Å følge SKILL.md bokstavelig fører umiddelbart til en blindvei: blastn er ikke installert og det er ingen reserveveiledning, mens et enkelt Python-skript på fem linjer fant den samme 95 % sekvensidentiteten på under et sekund.

Testet på: 2026-07-14 · Claude Code 2.x (agent harness)

Installer

git clone https://github.com/BioTender-max/awesome-bio-agent-skills
cd awesome-bio-agent-skills
mkdir -p ~/.claude/skills
cp -r skills/bioclaw/blast-search ~/.claude/skills/blast-search

Kommandoer og eksempelprompter

  • /blast-searchKjører NCBI BLAST-søk etter sekvenslikhet/homologi — krever BLAST+ eller BioPython forhåndsinstallert.

Skills utløses av vanlige forespørsler — ingen kommandoer å huske. Etter installasjonen aktiverer prompter som disse skillen (på engelsk):

  • Can you BLAST this DNA sequence against the nt database for me?
  • I need to find genes similar to this protein sequence via homology.
  • Run a local blastp search comparing these two protein sequences.

Full rapport →