Blast Search
Voert NCBI BLAST-zoekopdrachten uit voor sequentie-gelijkenis/homologie — vereist BLAST+ of BioPython vooraf geïnstalleerd.
Tested · Didn't pass
Wat het doet
Voert lokale (blastn/blastp/blastx/tblastn) of externe NCBI BLAST+-zoekopdrachten uit om vergelijkbare DNA-, RNA- of eiwitsequenties te vinden en genen te identificeren via homologie, waarbij treffers worden gepresenteerd als een gerangschikte tabel met identiteit en E-waarden. Activeert bij verzoeken om een sequentie te BLASTen, vergelijkbare sequenties te vinden of een homologiezoekopdracht uit te voeren. De instructies gaan uit van een voorgeconfigureerde bio-informatica-container met BLAST+ en BioPython reeds geïnstalleerd, en bieden geen terugval als die binaries ontbreken.
Testrapport
Het letterlijk volgen van de SKILL.md loopt onmiddellijk vast: blastn is niet geïnstalleerd en er is geen terugvalbegeleiding, terwijl een eenvoudig Python-script van vijf regels dezelfde 95% sequentie-identiteit in minder dan een seconde vond.
Getest op: 2026-07-14 · Claude Code 2.x (agent harness)
Installatie
git clone https://github.com/BioTender-max/awesome-bio-agent-skills cd awesome-bio-agent-skills mkdir -p ~/.claude/skills cp -r skills/bioclaw/blast-search ~/.claude/skills/blast-search
Commando's en voorbeeldprompts
/blast-searchVoert NCBI BLAST-zoekopdrachten uit voor sequentie-gelijkenis/homologie — vereist BLAST+ of BioPython vooraf geïnstalleerd.
Skills reageren op gewone verzoeken — geen commando's om te onthouden. Na installatie activeren prompts zoals deze de skill (in het Engels):
Can you BLAST this DNA sequence against the nt database for me?I need to find genes similar to this protein sequence via homology.Run a local blastp search comparing these two protein sequences.