MATLAB Fit SimBiology Model
Pattern corretti fitproblem/NLME/NCA per il fitting PK in SimBiology; individua le insidie di sbiofit.
Promosso
Cosa fa
Codifica il workflow corretto basato su `fitproblem` per la stima dei parametri in SimBiology — wrapping di groupedData, sintassi ResponseMap, bound, trasformazione logaritmica, modelli di errore, scelta tra NLME e sbiofit, pazienti virtuali e NCA — così un agente non ricorre alle chiamate posizionali dirette sbiofit/sbiofitmixed, soggette a errori, contro cui mette esplicitamente in guardia. Si attiva su linguaggio fit/estimate/calibrate/population/NCA/AUC; esclude esplicitamente la costruzione di modelli e le richieste di pura analisi di sensitività, che vengono instradate a skill gemelle.
Rapporto di test
Confrontato il codice per un fitting PK orale a un compartimento: la baseline senza skill chiama sbiofit direttamente con una tabella semplice e senza bound (esattamente il pattern soggetto a errori contro cui mettono in guardia i documenti dello skill); la versione guidata dallo skill avvolge groupedData, imposta ResponseMap='Drug = Drug', aggiunge bound più trasformazione logaritmica su ke/ka, e parte con scattersearch secondo la tabella decisionale.
Testato il: 2026-07-13 · Claude Code 2.x (agent harness)
Installazione
git clone https://github.com/matlab/matlab-agentic-toolkit cd matlab-agentic-toolkit mkdir -p ~/.claude/skills cp -r skills-catalog/computational-biology/matlab-fit-simbiology-model ~/.claude/skills/matlab-fit-simbiology-model
Comandi e prompt di esempio
/matlab-fit-simbiology-modelPattern corretti fitproblem/NLME/NCA per il fitting PK in SimBiology; individua le insidie di sbiofit.
Gli skill si attivano con richieste in linguaggio naturale, senza comandi da ricordare. Dopo l'installazione, prompt come questi lo attivano (in inglese):
Help me fit this PK model in SimBiology using fitproblem correctlyI need to calibrate population parameters with NLME instead of sbiofitSet up bounds and log-transform for this SimBiology parameter estimation