Blast Search
Exécute des recherches NCBI BLAST pour la similarité/homologie de séquences — nécessite BLAST+ ou BioPython préinstallé.
Tested · Didn't pass
Ce que fait
Exécute des recherches NCBI BLAST+ locales (blastn/blastp/blastx/tblastn) ou distantes pour trouver des séquences d'ADN, d'ARN ou de protéines similaires et identifier des gènes par homologie, présentant les résultats sous forme de tableau classé avec identité et valeurs E. Se déclenche sur les requêtes pour BLAST une séquence, trouver des séquences similaires ou effectuer une recherche d'homologie. Les instructions supposent un conteneur bioinformatique préconfiguré avec BLAST+ et BioPython déjà installés, et ne fournissent aucune solution de repli si ces binaires sont manquants.
Rapport de test
Suivre littéralement le SKILL.md mène immédiatement à une impasse : blastn n'est pas installé et il n'y a pas de guide de repli, alors qu'un simple script Python de cinq lignes a trouvé la même identité de séquence de 95% en moins d'une seconde.
Testé le: 2026-07-14 · Claude Code 2.x (agent harness)
Installation
git clone https://github.com/BioTender-max/awesome-bio-agent-skills cd awesome-bio-agent-skills mkdir -p ~/.claude/skills cp -r skills/bioclaw/blast-search ~/.claude/skills/blast-search
Commandes et exemples de prompts
/blast-searchExécute des recherches NCBI BLAST pour la similarité/homologie de séquences — nécessite BLAST+ ou BioPython préinstallé.
Les skills se déclenchent sur des demandes en langage courant — aucune commande à retenir. Après installation, des prompts comme ceux-ci l'activent (en anglais) :
Can you BLAST this DNA sequence against the nt database for me?I need to find genes similar to this protein sequence via homology.Run a local blastp search comparing these two protein sequences.