MATLAB Fit SimBiology Model
Patrones correctos de fitproblem/NLME/NCA para ajuste PK en SimBiology; detecta las trampas de sbiofit.
Probado · Funciona
Qué hace
Codifica el flujo de trabajo correcto basado en `fitproblem` para la estimación de parámetros en SimBiology -- envoltura con groupedData, sintaxis de ResponseMap, límites, transformación logarítmica, modelos de error, selección entre NLME y sbiofit, pacientes virtuales y NCA -- para que un agente no recurra a las llamadas posicionales directas y propensas a errores de sbiofit/sbiofitmixed que advierte explícitamente evitar. Se activa con lenguaje de fit/estimate/calibrate/population/NCA/AUC; excluye explícitamente la construcción de modelos y las solicitudes de análisis de sensibilidad puro, que se enrutan a skills hermanas.
Informe de la prueba
Se comparó el código de un ajuste PK oral de un compartimento: el punto de referencia sin skill llama a sbiofit directamente con una tabla plana y sin límites (exactamente el patrón propenso a errores que la propia documentación de la skill advierte evitar); la versión guiada por la skill envuelve con groupedData, fija ResponseMap='Drug = Drug', añade límites más transformación logarítmica en ke/ka, y arranca con scattersearch según la tabla de decisión.
Probado el: 2026-07-13 · Claude Code 2.x (agent harness)
Instalación
git clone https://github.com/matlab/matlab-agentic-toolkit cd matlab-agentic-toolkit mkdir -p ~/.claude/skills cp -r skills-catalog/computational-biology/matlab-fit-simbiology-model ~/.claude/skills/matlab-fit-simbiology-model
Comandos y prompts de ejemplo
/matlab-fit-simbiology-modelPatrones correctos de fitproblem/NLME/NCA para ajuste PK en SimBiology; detecta las trampas de sbiofit.
Los skills se activan con peticiones en lenguaje natural, sin comandos que memorizar. Tras instalarlo, prompts como estos lo activan (en inglés):
Help me fit this PK model in SimBiology using fitproblem correctlyI need to calibrate population parameters with NLME instead of sbiofitSet up bounds and log-transform for this SimBiology parameter estimation