Blast Search

Ejecuta búsquedas NCBI BLAST para similitud/homología de secuencias — requiere BLAST+ o BioPython preinstalado.

Por BioTender-max · BioTender-max/awesome-bio-agent-skills

Tested · Didn't pass

Blast Search — Ejecuta búsquedas NCBI BLAST para similitud/homología de secuencias — requiere BLAST+ o BioPython preinstalado.

Qué hace

Ejecuta búsquedas locales (blastn/blastp/blastx/tblastn) o remotas de NCBI BLAST+ para encontrar secuencias de ADN, ARN o proteínas similares e identificar genes por homología, presentando los resultados como una tabla clasificada con identidad y valores E. Se activa con solicitudes para BLASTear una secuencia, encontrar secuencias similares o ejecutar una búsqueda de homología. Las instrucciones asumen un contenedor bioinformático preconfigurado con BLAST+ y BioPython ya instalados, y no ofrecen una alternativa si faltan esos binarios.

Informe de la prueba

Seguir el SKILL.md literalmente choca con un muro inmediatamente: blastn no está instalado y no hay guía de respaldo, mientras que un script Python simple de cinco líneas encontró la misma identidad de secuencia del 95% en menos de un segundo.

Probado el: 2026-07-14 · Claude Code 2.x (agent harness)

Instalación

git clone https://github.com/BioTender-max/awesome-bio-agent-skills
cd awesome-bio-agent-skills
mkdir -p ~/.claude/skills
cp -r skills/bioclaw/blast-search ~/.claude/skills/blast-search

Comandos y prompts de ejemplo

  • /blast-searchEjecuta búsquedas NCBI BLAST para similitud/homología de secuencias — requiere BLAST+ o BioPython preinstalado.

Los skills se activan con peticiones en lenguaje natural, sin comandos que memorizar. Tras instalarlo, prompts como estos lo activan (en inglés):

  • Can you BLAST this DNA sequence against the nt database for me?
  • I need to find genes similar to this protein sequence via homology.
  • Run a local blastp search comparing these two protein sequences.