MATLAB Fit SimBiology Model
Korrekte fitproblem-/NLME-/NCA-Muster für SimBiology-PK-Fitting; erkennt sbiofit-Fallstricke.
Getestet · Funktioniert
Was es kann
Kodiert den korrekten `fitproblem`-basierten Workflow für die SimBiology-Parameterschätzung - groupedData-Wrapping, ResponseMap-Syntax, Bounds, Log-Transformation, Fehlermodelle, NLME- vs. sbiofit-Auswahl, virtuelle Patienten und NCA - damit ein Agent nicht auf die fehleranfälligen direkten sbiofit-/sbiofitmixed-Positionsaufrufe zurückgreift, vor denen er explizit warnt. Triggert bei fit-/estimate-/calibrate-/population-/NCA-/AUC-Sprache; schließt explizit Modellaufbau und reine Sensitivitätsanalyse-Anfragen aus, die zu Geschwister-Skills geroutet werden.
Testbericht
Code für einen Ein-Kompartiment-oralen-PK-Fit verglichen: Die skill-lose Baseline ruft sbiofit direkt mit einer einfachen Tabelle und ohne Bounds auf (genau das fehleranfällige Muster, vor dem die eigene Dokumentation des Skills warnt); die skill-geführte Version wrappt groupedData, setzt ResponseMap='Drug = Drug', fügt Bounds plus Log-Transformation auf ke/ka hinzu und startet gemäß Entscheidungstabelle mit scattersearch.
Getestet am: 2026-07-13 · Claude Code 2.x (agent harness)
Installation
git clone https://github.com/matlab/matlab-agentic-toolkit cd matlab-agentic-toolkit mkdir -p ~/.claude/skills cp -r skills-catalog/computational-biology/matlab-fit-simbiology-model ~/.claude/skills/matlab-fit-simbiology-model
Befehle & Beispiel-Prompts
/matlab-fit-simbiology-modelKorrekte fitproblem-/NLME-/NCA-Muster für SimBiology-PK-Fitting; erkennt sbiofit-Fallstricke.
Skills reagieren auf normale Anfragen — keine Slash-Befehle nötig. Nach der Installation aktivieren Prompts wie diese den Skill (auf Englisch):
Help me fit this PK model in SimBiology using fitproblem correctlyI need to calibrate population parameters with NLME instead of sbiofitSet up bounds and log-transform for this SimBiology parameter estimation