Blast Search
Führt NCBI BLAST-Suchen nach Sequenzähnlichkeit/Homologie durch — erfordert vorinstalliertes BLAST+ oder BioPython.
Tested · Didn't pass
Was es kann
Führt lokale (blastn/blastp/blastx/tblastn) oder entfernte NCBI BLAST+-Suchen durch, um ähnliche DNA-, RNA- oder Proteinsequenzen zu finden und Gene durch Homologie zu identifizieren. Treffer werden als rangierte Tabelle mit Identität und E-Werten präsentiert. Wird ausgelöst bei Anfragen zum BLASTen einer Sequenz, zum Finden ähnlicher Sequenzen oder zum Durchführen einer Homologiesuche. Die Anweisungen setzen einen vorkonfigurierten Bioinformatik-Container mit bereits installiertem BLAST+ und BioPython voraus und bieten keine Fallback-Option, wenn diese Binärdateien fehlen.
Testbericht
Das Befolgen der SKILL.md führt sofort zu einem Problem: blastn ist nicht installiert und es gibt keine Fallback-Anleitung, während ein einfaches fünfzeiliges Python-Skript dieselbe 95%ige Sequenzidentität in weniger als einer Sekunde fand.
Getestet am: 2026-07-14 · Claude Code 2.x (agent harness)
Installation
git clone https://github.com/BioTender-max/awesome-bio-agent-skills cd awesome-bio-agent-skills mkdir -p ~/.claude/skills cp -r skills/bioclaw/blast-search ~/.claude/skills/blast-search
Befehle & Beispiel-Prompts
/blast-searchFührt NCBI BLAST-Suchen nach Sequenzähnlichkeit/Homologie durch — erfordert vorinstalliertes BLAST+ oder BioPython.
Skills reagieren auf normale Anfragen — keine Slash-Befehle nötig. Nach der Installation aktivieren Prompts wie diese den Skill (auf Englisch):
Can you BLAST this DNA sequence against the nt database for me?I need to find genes similar to this protein sequence via homology.Run a local blastp search comparing these two protein sequences.