MATLAB Fit SimBiology Model
Korrekte fitproblem/NLME/NCA-mønstre til SimBiology PK-fitting; fanger sbiofit-faldgruber.
Testet · Virker
Hvad det gør
Koder det korrekte `fitproblem`-baserede workflow til SimBiology-parameterestimering — groupedData-indpakning, ResponseMap-syntaks, grænser, log-transformation, fejlmodeller, valg mellem NLME og sbiofit, virtuelle patienter og NCA — så en agent ikke griber til de fejlbehæftede direkte positionelle kald til sbiofit/sbiofitmixed, som den eksplicit advarer imod. Udløses ved sprog som fit/estimate/calibrate/population/NCA/AUC; udelukker eksplicit modelkonstruktion og rene sensitivitetsanalyse-anmodninger, som routes til sideordnede skills.
Testrapport
Sammenlignede kode til en one-compartment oral-PK-fitting: baseline uden skill kalder sbiofit direkte med en almindelig tabel og ingen grænser (præcis det fejlbehæftede mønster, skillets egen dokumentation advarer imod); den skill-guidede version indpakker groupedData, sætter ResponseMap='Drug = Drug', tilføjer grænser plus log-transformation på ke/ka, og starter med scattersearch i henhold til beslutningstabellen.
Testet: 2026-07-13 · Claude Code 2.x (agent harness)
Installation
git clone https://github.com/matlab/matlab-agentic-toolkit cd matlab-agentic-toolkit mkdir -p ~/.claude/skills cp -r skills-catalog/computational-biology/matlab-fit-simbiology-model ~/.claude/skills/matlab-fit-simbiology-model
Kommandoer og eksempelprompter
/matlab-fit-simbiology-modelKorrekte fitproblem/NLME/NCA-mønstre til SimBiology PK-fitting; fanger sbiofit-faldgruber.
Skills udløses af almindelige forespørgsler — ingen kommandoer at huske. Efter installationen aktiverer prompter som disse skillen (på engelsk):
Help me fit this PK model in SimBiology using fitproblem correctlyI need to calibrate population parameters with NLME instead of sbiofitSet up bounds and log-transform for this SimBiology parameter estimation