Blast Search
Spouští NCBI BLAST vyhledávání pro podobnost/homologii sekvencí — vyžaduje předinstalovaný BLAST+ nebo BioPython.
Tested · Didn't pass
Co umí
Spouští lokální (blastn/blastp/blastx/tblastn) nebo vzdálená NCBI BLAST+ vyhledávání pro nalezení podobných DNA, RNA nebo proteinových sekvencí a identifikaci genů pomocí homologie, přičemž výsledky prezentuje jako seřazenou tabulku s identitou a E-hodnotami. Spouští se na požadavky k BLASTování sekvence, nalezení podobných sekvencí nebo spuštění homologického vyhledávání. Instrukce předpokládají předkonfigurovaný bioinformatický kontejner s již nainstalovanými BLAST+ a BioPython a neposkytují žádnou záložní možnost, pokud tyto binární soubory chybí.
Testovací report
Doslovné dodržení SKILL.md okamžitě narazí na problém: blastn není nainstalován a neexistuje žádné záložní řešení, zatímco jednoduchý pětiřádkový Python skript našel stejnou 95% identitu sekvence za méně než sekundu.
Testováno: 2026-07-14 · Claude Code 2.x (agent harness)
Instalace
git clone https://github.com/BioTender-max/awesome-bio-agent-skills cd awesome-bio-agent-skills mkdir -p ~/.claude/skills cp -r skills/bioclaw/blast-search ~/.claude/skills/blast-search
Příkazy a ukázkové prompty
/blast-searchSpouští NCBI BLAST vyhledávání pro podobnost/homologii sekvencí — vyžaduje předinstalovaný BLAST+ nebo BioPython.
Skilly se spouštějí běžnými požadavky — žádné příkazy k zapamatování. Po instalaci ho aktivují prompty jako tyto (anglicky):
Can you BLAST this DNA sequence against the nt database for me?I need to find genes similar to this protein sequence via homology.Run a local blastp search comparing these two protein sequences.