Build SimBiology Models
Tät SimBiology API-/regelreferens som förhindrar verkliga fel med tvetydiga species och föråldrade egenskaper.
Testad · Fungerar
Vad den gör
Den här skillen är en 499-raders API-referens och regeluppsättning för att programmatiskt bygga och diagramlägga SimBiology-modeller - den täcker kvalificerad species-namngivning, moderna egenskapsnamn (Value/Units/Constant), konventioner för reaktionsriktning, regel-/händelsebegränsningar och matematik för diagramlayout. Den triggas av 'build/add/modify compartment, species, reaction, diagram, layout' och avstår uttryckligen från simulerings- och parameteranpassningsförfrågningar till förmån för systerskills.
Testrapport
Bad båda vägarna koppla ihop en tvåkomponents-PK-modell med en 'Drug'-species i varje komponent: den oassisterade baseline skrev okvalificerade species-referenser som SimBiology avvisar som tvetydiga mellan komponenter, medan skillens regel 5 (använd alltid kvalificerade namn i formen Compartment.Species) gav reaktionssträngar som faktiskt är giltiga.
Testad: 2026-07-13 · Claude Code 2.x (agent harness)
Installation
git clone https://github.com/matlab/matlab-agentic-toolkit cd matlab-agentic-toolkit mkdir -p ~/.claude/skills cp -r skills-catalog/computational-biology/matlab-build-simbiology-model ~/.claude/skills/matlab-build-simbiology-model
Kommandon och exempelprompter
/matlab-build-simbiology-modelTät SimBiology API-/regelreferens som förhindrar verkliga fel med tvetydiga species och föråldrade egenskaper.
Skills triggas av vanliga förfrågningar — inga kommandon att memorera. Efter installationen aktiverar prompter som dessa skillen (på engelska):
Help me add a species and reaction to my SimBiology modelBuild a compartment diagram programmatically in SimBiologyFix the ambiguous species naming error in my SimBiology script