ROBOT OBO Tool

Kommandoreferanse for ROBOT, standard OBO-ontology CLI: resonnering, TSV-til-OWL-maler, QC, formatkonvertering.

av ai4curation · ai4curation/curation-skills

Bestått ★ 9.6/10

ROBOT OBO Tool — Kommandoreferanse for ROBOT, standard OBO-ontology CLI: resonnering, TSV-til-OWL-maler, QC, formatkonvertering.

Hva den gjør

En referanseguide (SKILL.md + 8 dokumenter/dypdykk-filer) for ROBOT, Java CLI-en som brukes av nesten alle OBO Foundry-ontology-byggelinjer, som dekker resonnering (ELK/HermiT), malbasert termgenerering fra TSV/CSV, kvalitetskontrollrapporter, formatkonvertering, moduluthenting, SPARQL-spørringer og kommandokjeding. Utløses når brukeren jobber med OWL/OBO-ontology-filer og trenger et automatisert bygg-/QC-/konverteringstrinn.

Testrapport

Installerte ekte Java + lastet ned den faktiske ROBOT jar-filen fra ontodev/robot og kjørte den live: en naiv mal TSV (ingen ferdighetsveiledning) feilet umiddelbart med UNKNOWN TEMPLATE ERROR, mens ferdighetens dokumenterte 3-rads malformat (overskrifter / malstrenger som 'SC %' og 'A rdfs:comment' / data) produserte gyldig OWL som deretter ble konvertert rent til OBO med den eksakte dokumenterte kommandoen.

Testet på: 2026-07-15 · Claude Code 2.x (agent harness)

Installer

git clone https://github.com/ai4curation/curation-skills
cd curation-skills
mkdir -p ~/.claude/skills
cp -r robot-obo-tool ~/.claude/skills/robot-obo-tool

Kommandoer og eksempelprompter

/robot-obo-toolKommandoreferanse for ROBOT, standard OBO-ontology CLI: resonnering, TSV-til-OWL-maler, QC, formatkonvertering.

Skills utløses av vanlige forespørsler — ingen kommandoer å huske. Etter installasjonen aktiverer prompter som disse skillen (på engelsk):

Generate OWL term classes from this TSV using robot template
Convert my OWL ontology file to OBO format with robot convert
Run a QC report on this OBO ontology and check for reasoning errors

Full rapport →