SkillProof tested Claude skills

anndata

Jobber med .h5ad-annoterte matrisefiler for enkeltcelledata i scverse-økosystemet.

av K-Dense-AI · K-Dense-AI/scientific-agent-skills

Krever oppsett ★ 7.6/10

anndata — Jobber med .h5ad-annoterte matrisefiler for enkeltcelledata i scverse-økosystemet.

Hva den gjør

Datastruktur for annoterte matriser i enkeltcelleanalyse. Bruk når du jobber med .h5ad-filer eller integrerer med scverse-økosystemet. Dette er dataformat-skillet — for analyseflyter bruk scanpy; for probabilistiske modeller bruk scvi-tools; for spørringer i populasjonsskala bruk cellxgene-census.

Testrapport

Verbatim installasjon (git clone + cp) fungerer rent; SKILL.md-frontmatter parses som streng YAML med alle 5 refererte filer til stede, og hvert dokumenterte API (AnnData-konstruksjon, ad.concat, sparse-konvertering, h5ad backed-mode I/O, zarr-innstillinger) kjører korrekt mot den ekte anndata-pakken. På en A/B-oppgave med å bygge og filtrere et AnnData-objekt produserte skill- og base-armen funksjonelt identiske, korrekte, idiomatiske skript (begge droppet cellen med bare nuller, begge skrev/lastet inn h5ad på nytt i backed mode), så skillet ga ingen målbar outputfordel på denne oppgaven. Krever at Python-pakken anndata er installert (pip install anndata); ingen API-nøkler eller eksterne tjenester nødvendig.

Testet på: 2026-07-11 · Claude Code 2.x (agent harness)

Installer

git clone https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills
cd scientific-agent-skills
mkdir -p ~/.claude/skills
cp -r skills/anndata ~/.claude/skills/anndata

Kommandoer og eksempelprompter

  • /anndataJobber med .h5ad-annoterte matrisefiler for enkeltcelledata i scverse-økosystemet.

Skills utløses av vanlige forespørsler — ingen kommandoer å huske. Etter installasjonen aktiverer prompter som disse skillen (på engelsk):

  • Load and inspect this .h5ad single-cell dataset
  • Convert my single-cell data into an AnnData object
  • Subset this AnnData file by cell type

Full rapport →