ROBOT OBO Tool

Commandreferentie voor ROBOT, de standaard OBO-ontology CLI: redeneren, TSV-naar-OWL templates, QC, formaatconversie.

Door ai4curation · ai4curation/curation-skills

Getest · Werkt ★ 9.6/10

ROBOT OBO Tool — Commandreferentie voor ROBOT, de standaard OBO-ontology CLI: redeneren, TSV-naar-OWL templates, QC, formaatconversie.

Wat het doet

Een referentiegids (SKILL.md + 8 docs/ deep-dive bestanden) voor ROBOT, de Java CLI gebruikt door bijna elke OBO Foundry ontology build pipeline, die redeneren (ELK/HermiT), template-gebaseerde termgeneratie uit TSV/CSV, kwaliteitscontrole rapporten, formaatconversie, module-extractie, SPARQL queries, en command chaining behandelt. Triggers wanneer de gebruiker werkt met OWL/OBO ontology bestanden en een geautomatiseerde build/QC/conversiestap nodig heeft.

Testrapport

Echte Java geïnstalleerd + de daadwerkelijke ROBOT jar gedownload van ontodev/robot en live uitgevoerd: een naïeve template TSV (geen skill-begeleiding) faalde onmiddellijk met UNKNOWN TEMPLATE ERROR, terwijl het gedocumenteerde 3-rij template formaat van de skill (headers / template-strings zoals 'SC %' en 'A rdfs:comment' / data) valide OWL produceerde dat vervolgens schoon werd geconverteerd naar OBO met het exacte gedocumenteerde commando.

Getest op: 2026-07-15 · Claude Code 2.x (agent harness)

Installatie

git clone https://github.com/ai4curation/curation-skills
cd curation-skills
mkdir -p ~/.claude/skills
cp -r robot-obo-tool ~/.claude/skills/robot-obo-tool

Commando's en voorbeeldprompts

/robot-obo-toolCommandreferentie voor ROBOT, de standaard OBO-ontology CLI: redeneren, TSV-naar-OWL templates, QC, formaatconversie.

Skills reageren op gewone verzoeken — geen commando's om te onthouden. Na installatie activeren prompts zoals deze de skill (in het Engels):

Generate OWL term classes from this TSV using robot template
Convert my OWL ontology file to OBO format with robot convert
Run a QC report on this OBO ontology and check for reasoning errors

Volledig rapport (Engels) →