Build SimBiology Models

Dichte SimBiology API-/regelreferentie die echte dubbelzinnige-species- en verouderde-property-fouten voorkomt.

Door matlab · matlab/matlab-agentic-toolkit

Getest · Werkt ★ 9.6/10

Build SimBiology Models — Dichte SimBiology API-/regelreferentie die echte dubbelzinnige-species- en verouderde-property-fouten voorkomt.

Wat het doet

Deze skill is een 499-regels API-referentie en regelset voor het programmatisch opbouwen en diagrammeren van SimBiology-modellen — met qualified species-naamgeving, moderne propertynamen (Value/Units/Constant), reactierichtingconventies, regel-/eventbeperkingen en diagram-layoutwiskunde. Het triggert op 'build/add/modify compartment, species, reaction, diagram, layout' en verwijst simulatie- en parameter-fitting-verzoeken expliciet door naar zusterskills.

Testrapport

Vroeg beide paden om een two-compartment PK-model met een 'Drug'-species in elk compartiment te bedraden: de ongestuurde baseline schreef unqualified species-referenties die SimBiology als dubbelzinnig afwijst over compartimenten heen, terwijl Regel 5 van de skill (altijd Compartment.Species qualified namen gebruiken) reactiestrings opleverde die daadwerkelijk geldig zijn.

Getest op: 2026-07-13 · Claude Code 2.x (agent harness)

Installatie

git clone https://github.com/matlab/matlab-agentic-toolkit
cd matlab-agentic-toolkit
mkdir -p ~/.claude/skills
cp -r skills-catalog/computational-biology/matlab-build-simbiology-model ~/.claude/skills/matlab-build-simbiology-model

Commando's en voorbeeldprompts

/matlab-build-simbiology-modelDichte SimBiology API-/regelreferentie die echte dubbelzinnige-species- en verouderde-property-fouten voorkomt.

Skills reageren op gewone verzoeken — geen commando's om te onthouden. Na installatie activeren prompts zoals deze de skill (in het Engels):

Help me add a species and reaction to my SimBiology model
Build a compartment diagram programmatically in SimBiology
Fix the ambiguous species naming error in my SimBiology script

Volledig rapport (Engels) →