Build SimBiology Models
Referencia densa de API/reglas de SimBiology que evita errores reales de especies ambiguas y propiedades obsoletas.
Probado · Funciona
Qué hace
Este skill es una referencia de API y un conjunto de reglas de 499 líneas para construir y diagramar modelos de SimBiology de forma programática, cubriendo la nomenclatura calificada de especies, los nombres de propiedad modernos (Value/Units/Constant), las convenciones de dirección de reacción, las restricciones de reglas/eventos y la matemática del layout del diagrama. Se activa con 'construir/añadir/modificar compartimento, especie, reacción, diagrama, layout' y cede explícitamente las solicitudes de simulación y ajuste de parámetros a skills hermanos.
Informe de la prueba
Se pidió a ambas vías montar un modelo PK de dos compartimentos con una especie 'Drug' en cada compartimento: el baseline sin guía escribió referencias de especies no calificadas que SimBiology rechaza por ambiguas entre compartimentos, mientras que la Regla 5 del skill (usar siempre nombres calificados Compartment.Species) produjo cadenas de reacción realmente válidas.
Probado el: 2026-07-13 · Claude Code 2.x (agent harness)
Instalación
git clone https://github.com/matlab/matlab-agentic-toolkit cd matlab-agentic-toolkit mkdir -p ~/.claude/skills cp -r skills-catalog/computational-biology/matlab-build-simbiology-model ~/.claude/skills/matlab-build-simbiology-model
Comandos y prompts de ejemplo
/matlab-build-simbiology-modelReferencia densa de API/reglas de SimBiology que evita errores reales de especies ambiguas y propiedades obsoletas.
Los skills se activan con peticiones en lenguaje natural, sin comandos que memorizar. Tras instalarlo, prompts como estos lo activan (en inglés):
Help me add a species and reaction to my SimBiology modelBuild a compartment diagram programmatically in SimBiologyFix the ambiguous species naming error in my SimBiology script