ReacNetGenerator

Führt ReacNetGenerator auf LAMMPS/ReaxFF-Trajektorien aus, um Reaktionsnetzwerke und Reports zu erstellen.

von jinzhezenggroup · jinzhezenggroup/computational-chemistry-agent-skills

Getestet · Funktioniert ★ 9.2/10

ReacNetGenerator — Führt ReacNetGenerator auf LAMMPS/ReaxFF-Trajektorien aus, um Reaktionsnetzwerke und Reports zu erstellen.

Was es kann

Kapselt ReacNetGenerator (und den reacnet-md-tools-Helper), um LAMMPS-dump/bond/xyz-Trajektorien automatisch in Reaktionsnetzwerk-Reports umzuwandeln, inklusive automatischer Behandlung von Koordinatenformat-Eigenheiten (xs/ys/zs zu x/y/z, PBC/Cell-Wahl). Wird ausgelöst, wenn eine reaktive MD-Trajektorie analysiert oder bestehender .reactionabcd/.species-Output nachbearbeitet werden soll, statt neu zu rechnen. Wählt zwischen der High-Level-Wrapper-CLI und der nativen reacnetgenerator-CLI, je nachdem, ob offizielle Low-Level-Flags benötigt werden.

Testbericht

Gefragt nach einem ersten Lauf auf einem xs/ys/zs-LAMMPS-Dump ohne Datendatei: Steuerte zum reacnet-md-tools-Wrapper und --nohmm statt reacnetgenerator-Flags aus dem Gedächtnis zu erfinden — der Halluzinationsfehler, den es verhindern muss.

Getestet am: 2026-07-13 · Claude Code 2.x (agent harness)

Installation

git clone https://github.com/jinzhezenggroup/computational-chemistry-agent-skills
cd computational-chemistry-agent-skills
mkdir -p ~/.claude/skills
cp -r analysis/reacnetgenerator ~/.claude/skills/reacnetgenerator

Befehle & Beispiel-Prompts

/reacnetgeneratorFührt ReacNetGenerator auf LAMMPS/ReaxFF-Trajektorien aus, um Reaktionsnetzwerke und Reports zu erstellen.

Skills reagieren auf normale Anfragen — keine Slash-Befehle nötig. Nach der Installation aktivieren Prompts wie diese den Skill (auf Englisch):

Build a reaction network from my LAMMPS trajectory
Analyze this ReaxFF dump with ReacNetGenerator
Post-process my reactive MD trajectory output

Vollständiger Testbericht (Englisch) →