Build SimBiology Models
Dichte SimBiology-API-/Regel-Referenz, die reale Fehler durch mehrdeutige Spezies und veraltete Properties verhindert.
Getestet · Funktioniert
Was es kann
Dieser Skill ist eine 499-zeilige API-Referenz und Regelsammlung für den programmatischen Aufbau und die Diagrammdarstellung von SimBiology-Modellen – sie deckt qualifizierte Spezies-Benennung, moderne Property-Namen (Value/Units/Constant), Konventionen zur Reaktionsrichtung, Regel-/Event-Beschränkungen und die Diagramm-Layout-Mathematik ab. Reagiert auf „Compartment/Species/Reaction/Diagram/Layout erstellen/hinzufügen/ändern" und tritt bei Simulations- und Parameter-Fitting-Anfragen explizit an Schwester-Skills ab.
Testbericht
Beide Pfade wurden gebeten, ein Zwei-Compartment-PK-Modell mit einer „Drug"-Spezies in jedem Compartment zu verdrahten: Die ungeführte Baseline schrieb unqualifizierte Spezies-Referenzen, die SimBiology compartment-übergreifend als mehrdeutig zurückweist, während Regel 5 des Skills (immer Compartment.Species-qualifizierte Namen verwenden) tatsächlich gültige Reaktionsstrings erzeugte.
Getestet am: 2026-07-13 · Claude Code 2.x (agent harness)
Installation
git clone https://github.com/matlab/matlab-agentic-toolkit cd matlab-agentic-toolkit mkdir -p ~/.claude/skills cp -r skills-catalog/computational-biology/matlab-build-simbiology-model ~/.claude/skills/matlab-build-simbiology-model
Befehle & Beispiel-Prompts
/matlab-build-simbiology-modelDichte SimBiology-API-/Regel-Referenz, die reale Fehler durch mehrdeutige Spezies und veraltete Properties verhindert.
Skills reagieren auf normale Anfragen — keine Slash-Befehle nötig. Nach der Installation aktivieren Prompts wie diese den Skill (auf Englisch):
Help me add a species and reaction to my SimBiology modelBuild a compartment diagram programmatically in SimBiologyFix the ambiguous species naming error in my SimBiology script